Apa itu pneumonia Malaysia?

Highlight

• Pengangkut bakteri di saluran pernapasan bagian atas di Malaysia kurang dipahami

• Klebsiella pneumoniae adalah bakteri yang paling umum diisolasi

• 33. 8% isolat resisten terhadap setidaknya satu antibiotik

pengantar

Infeksi saluran pernapasan bawah, termasuk pneumonia, merupakan penyebab kematian keenam di semua usia secara global, dan penyebab utama kematian pada anak usia 4 tahun ke bawah [1]. Di Malaysia, pneumonia merupakan penyebab kematian kedua tertinggi di semua usia pada tahun 2017 [2]. Pneumonia yang didapat masyarakat (CAP) dikaitkan dengan 4. Tingkat kematian 2% [3], yang lebih rendah dari angka yang dipublikasikan di negara-negara Barat (7. 7–12%) [4, 5]. Hal ini mungkin karena pelaporan yang kurang ketat di Malaysia dan oleh karena itu perkiraan kematian yang terlalu rendah

Sementara banyak penelitian menentukan etiologi pneumonia di negara-negara Barat, epidemiologinya di Malaysia kurang dipahami. Secara global S. pneumoniae dilaporkan sebagai penyebab paling umum dari pneumonia bakteri [6]. Vaksin konjugasi pneumokokus (PCV) menawarkan perlindungan terhadap serotipe S. pneumoniae paling sering dikaitkan dengan penyakit atau resistensi antimikroba (AMR), dan termasuk dalam program imunisasi nasional (NIP) dari 144 negara di seluruh dunia [7]. Hingga Juni 2020, Malaysia, Thailand, Sri Lanka, China, dan Vietnam belum memasukkan PCV ke dalam NIP mereka [8]; . Jenis vaksin PCV (VT) 19F, 14, 6B, 1 dan 19A adalah penyebab utama penyakit pneumokokus invasif (IPD) di Malaysia, sedangkan 19F, 23F, 14, 6B, 1 dan 3 adalah penyebab paling umum di Asia Tenggara [10], oleh karena itu implementasi PCV kemungkinan bermanfaat untuk pengurangan IPD dan penyakit lain termasuk pneumonia pneumokokus

Selain S. pneumoniae, patogen 'ESKAPE' yang resistan terhadap banyak obat seperti K. pneumoniae telah dilaporkan sebagai organisme penyebab umum CAP [11, 12]. Berbeda dengan negara-negara Barat, studi dari Asia menunjukkan K. pneumoniae adalah penyebab pneumonia yang lebih menonjol daripada S. pneumonia dan H. influenzae, [13,14,15] dengan data dari Malaysia menunjukkan K. pneumoniae menjadi penyebab paling menonjol [16]. Seperti S. pneumoniae, Organisasi Kesehatan Dunia menganggap K. pneumoniae patogen AMR prioritas yang membutuhkan kontrol. Namun strategi pencegahan terhalang oleh tingginya tingkat keragaman strain [17]. K. pneumoniae oleh karena itu merupakan patogen yang memprihatinkan. Sementara saat ini belum ada vaksin untuk K. pneumoniae, penyakit akibat H. influenzae tipe b (Hib) telah berhasil direduksi melalui penerapan vaksin Hib. Meskipun implementasi vaksin Hib dan cakupan yang tinggi di Malaysia [18], H. influenzae (termasuk Hib) masih menjadi sumber utama penyakit seperti pneumonia dan penyebab utama meningitis [16, 19]

Karier merupakan prasyarat untuk penyakit [20], kami berusaha untuk meningkatkan pemahaman kami tentang prevalensi gerbong dan profil AMR dari patogen saluran pernapasan atas (URT) yang umum di Malaysia, khususnya yang terkait dengan pneumonia. Hal ini dilakukan dengan melakukan studi gerbong berbasis populasi. Secara khusus, kami berharap untuk menyelidiki bagian populasi Malaysia yang kurang dipelajari (komunitas pedesaan Sarawak)

Metode

Situs studi

Sarawak, Sabah dan Labuan terdiri dari Malaysia Timur; . Sarawak adalah negara bagian terbesar di Malaysia. Populasinya terdiri dari lebih dari 40 subkelompok etnis; . Banyak komunitas asli hidup menurut tradisi suku, bertempat tinggal di desa-desa yang terdiri dari rumah-rumah panjang, dengan bertani sebagai pekerjaan umum. Komunitas semacam itu dapat diisolasi karena lokasinya, membatasi akses ke obat-obatan modern dan layanan kesehatan. Namun, semakin umum bagi beberapa penduduk untuk bepergian, dengan beberapa tinggal di kota besar selama minggu kerja atau lebih, untuk bekerja dan belajar. Ini menawarkan akses yang lebih baik ke layanan kesehatan. Selain itu, inisiatif kesehatan pemerintah seperti dokter terbang bulanan dan Komuniti Sihat Pembina Negara (KOSPEN) meningkatkan kesehatan masyarakat di komunitas tersebut dengan meningkatkan akses ke profesional medis dan meningkatkan kesadaran melalui penggunaan relawan kesehatan masyarakat.

Lima komunitas pedesaan dijadikan sampel (Gambar. 1); . Meskipun hanya berjarak 30-40 km dari kota Bintulu, perjalanan ke Rumah Numpang memerlukan perjalanan longboat selama 20–30 min menyusuri sungai Sungai Pandan dan Sungai Sujan untuk mencapai masyarakat terpencil di lahan terbuka di hutan. Rumah Bana, komunitas yang makmur, tidak terlalu terisolasi terletak 20-30 km dari kota Bintulu di luar jalan utama dari kota Sebauh. Komunitas yang tersisa (Long Kerangan, Ba Marong dan Long Nen) sangat terisolasi, berlokasi di Ulu Baram, Miri, Sarawak. Long Kerangan adalah komunitas rumah panjang yang sangat kekurangan, terisolasi dan miskin, terletak 80 km dari Long Lama (kota terdekat dan penyedia layanan kesehatan) di tengah lahan hutan. Ba Marong adalah komunitas rumah panjang yang lebih terpencil, terletak di tengah hutan lebat 157 km dari Long Lama. Perjalanan ke lokasi ini membutuhkan truk dengan penggerak empat roda karena medan yang berat dan kurangnya jalan raya. Long Nen, sebuah desa daripada komunitas rumah panjang, terletak di dalam hutan lebat 99 km dari Long Lama. Masyarakat pedesaan yang dijadikan sampel sebagai bagian dari penelitian ini mencakup gaya hidup suku yang berbeda dan termasuk orang-orang dari etnis Iban, Kelabit, Kenyah dan Penan.

ara. 1

Peta situs rekrutmen. © Hak Cipta 2020. Multiplottr. com. Seluruh hak cipta. a Rumah Bana, Sebauh, Bintulu, Sarawak - Koordinat GPS 3. 142234, 113. 279135; . b Rumah Numpang, Sebauh, Bintulu, Sarawak - Koordinat GPS 3. 139950, 113. 418036; . c Long Kerangan, Ulu Baram, Miri, Sarawak - Koordinat GPS 3. 766312, 114. 841122; . d Ba Marong, Ulu Baram, Miri, Sarawak - Koordinat GPS 3. 680444, 115. 014777; . e Long Nen, Ulu Baram, Miri, Sarawak - Koordinat GPS 3. 679871, 114. 897062;

Gambar ukuran penuh

Pengerahan

Survei berbasis populasi tentang pembawa bakteri dilakukan pada peserta dari segala usia dari lima komunitas pedesaan di Sarawak, Malaysia selama April 2016. Komunitas pedesaan diidentifikasi oleh petugas kesehatan masyarakat setempat dan badan amal. Sebelum setiap survei, peneliti lokal mengirim surat ke/mendekati setiap sesepuh rumah panjang/pemimpin masyarakat untuk memberikan tinjauan studi dan meminta persetujuan tim untuk berkunjung. Peneliti mengunjungi masyarakat yang sesepuh/pemimpinnya memberikan persetujuan dan siapa saja yang hadir di setiap lokasi didekati dan diundang untuk berpartisipasi. Penerjemah dan petugas kesehatan masyarakat memfasilitasi perekrutan dan pengambilan sampel

Pengambilan sampel dan transportasi

Pengangkutan bakteri dari URT diambil sampelnya dengan mengambil swab seluruh mulut, hidung, orofaringeal (OP) dan nasofaring (NP) dari masing-masing peserta. Sampel NP pediatrik diambil menggunakan Transwab® Pernasal Amies berujung rayon dengan arang (Medical Wire and Equipment, Corsham, UK). Sampel NP dewasa dan semua sampel hidung dan OP diambil menggunakan penyeka Amies steril berujung viscose yang sesuai dengan arang (Deltalab, Chalgrove, UK). Setelah dikumpulkan, swab didinginkan jika memungkinkan sebelum diangkut oleh World Courier pada suhu sekitar ke University of Southampton, Inggris. Transportasi membutuhkan waktu 3-5 hari

Daftar pertanyaan

Peserta diminta untuk mengisi kuesioner yang meminta data demografis dasar. Orang tua/wali peserta anak bertanggung jawab atas pengisian kuesioner

Penilaian pembawa bakteri

Setibanya di laboratorium, masing-masing swab dibenamkan dan divortex dalam media penyimpanan susu skim, tripton, glukosa dan gliserin (STGG). Untuk setiap swab, 10 μL disepuh ke agar darah Columbia dengan darah kuda (CBA, Oxoid, UK), agar darah Columbia dengan darah kuda coklat (CHOC, Oxoid, UK), Agar Darah Columbia dengan Colisitin dan Asam Naladixic (CNA, Oxoid , UK), Columbia Agar dengan Chocolated Horse Blood dan Bacitracin (BACH, Oxoid, UK) dan Lysed GC Selective Agar (GC, Oxoid, UK). Pelat diinkubasi selama 24-48 jam pada suhu 37 °C dalam 5% CO2 dan diperiksa keberadaan Moraxella catarrhalis, S. pneumoniae, H. influenzae, Neisseria meningitidis, Staphylococcus aureus dan K. pneumoniae. Untuk isolasi Pseudomonas aeruginosa, 10 μL disepuh ke Pseudomonas CFC Selective agar (CFC, Oxoid, UK) dan diinkubasi selama 24–48 jam pada suhu 37 °C. Identifikasi utama dari semua spesies bakteri adalah dengan morfologi koloni. Bakteri yang diminati kemudian dikonfirmasi (Metode Tambahan 1) dan isolat dibekukan pada suhu − 80 °C di STGG

Serotipe pneumokokus

S. pneumoniae diserotipe dengan reaksi aglutinasi slide menggunakan Neufeld S. kit antisera pneumoniae (Statens Serum Institute, Kopenhagen, Denmark)

Kerentanan antibiotik

Isolat bakteri diuji secara fenotip untuk resistensi antibiotik menggunakan agar MRSA dan cakram antibiotik dan/atau strip konsentrasi hambat minimum (MIC), sesuai dengan EUCAST (Metode Tambahan 1)

Prevalensi pengangkutan

Prevalensi keretakan dihitung sebagai persentase dengan membagi jumlah bakteri yang diisolasi dengan jumlah total peserta yang diusap. Ini dilakukan untuk setiap spesies bakteri menurut lokasi sampel anatomi dan kelompok umur. Pengangkutan yang benar, didefinisikan sebagai identifikasi spesies bakteri dalam spesimen apa pun dari peserta individu terlepas dari lokasi atau jumlah tempat pengangkutan per orang, juga ditentukan.

Analisis statistik

Uji eksak Fisher digunakan untuk menentukan signifikansi hubungan antara variabel independen dan dependen (mis. g. pembawa bakteri dan kelompok umur). Nilai p dari 0. 05 digunakan sebagai ambang batas yang signifikan. Semua analisis data dilakukan dengan menggunakan GraphPad Prism versi 7. 03 untuk Windows (Perangkat Lunak GraphPad, San Diego, CA, AS)

Hasil

Total 140 peserta direkrut dari lima komunitas. Dikelompokkan berdasarkan usia, 8. 6% (n = 12) peserta berusia 0–4 tahun, 20. 0% (n = 28) berusia 5–17 tahun, 70. 7% (n = 99) berusia 18 tahun ke atas dan 0. 7% (n = 1) tidak diketahui usianya. 44. 3% (n = 62) peserta adalah laki-laki dan 54. 3% (n = 76) adalah perempuan, sementara 1. 4% (n = 2) peserta tidak memberikan jenis kelamin mereka. Mengenai etnis, 58. 6% (n = 82) peserta adalah Iban, 0. 7% (n = 1) Kelabit, 0. 7% (n = 1) Kenyah, 39. 3% (n = 55) peserta Penan dan 0. 7% (n = 1) tidak mencantumkan suku. Semua 140 peserta memberikan sampel usap mulut dan hidung; . 6% (n = 131) memberikan NP dan 92. 1% (n = 129) menyediakan sampel swab OP

Prevalensi pembawa bakteri ditentukan oleh situs sampel anatomi (Gambar. 2). Organisme yang paling sering diisolasi dari orofaring dan mulut adalah K. pneumoniae dengan prevalensi karier 27. 1% (95CI. 19. 7–35. 74%; . 9% (95CI. 7. 8–19. 6%; . Namun untuk nasofaring dan hidung, S. aureus paling banyak terjadi pada usia 13 tahun. 7% (95CI. 8. 4–20. 8%; . 1% (95CI. 7. 2–18. 7%; . Semua spesies lain yang diminati menunjukkan tingkat pengangkutan yang jauh lebih rendah di setiap lokasi anatomi yang diambil sampelnya. Pengangkutan yang sebenarnya juga ditentukan (Gbr. 3). K. pneumoniae adalah bakteri yang paling umum dengan prevalensi sebenarnya dari 30. 0% (95CI. 22. 6–38. 3%; . aureus pada usia 20. 7% (95CI. 14. 3–28. 4%; . pneumonia pada 10. 7% (95CI. 6. 1–17. 1%; . influenza pada 9. 3% (95CI. 5. 0–15. 4%; . katarak pada 6. 4% (95CI. 3. 0–11. 9%; . aeruginosa pada 6. 4% (95CI. 3. 0–11. 9%; . meningitis pada 5. 0% (95CI. 2. 0–10. 0%;

ara. 2

Prevalensi pembawa bakteri di setiap lokasi sampel anatomi. Prevalensi bar plot menunjukkan pengangkutan bakteri oleh lokasi sampel anatomi pada peserta yang direkrut dari komunitas pedesaan di Sarawak, Malaysia pada April 2016. Bilah kesalahan menunjukkan kesalahan standar

Gambar ukuran penuh

ara. 3

Pengangkut bakteri sejati dari setiap bakteri berdasarkan kelompok umur. Plot batang prevalensi menunjukkan prevalensi pembawaan bakteri sebenarnya berdasarkan usia pada peserta yang direkrut dari komunitas pedesaan di Sarawak, Malaysia pada April 2016. Pengangkutan yang sebenarnya didefinisikan sebagai setidaknya satu peristiwa pengangkutan yang diamati terlepas dari tempat isolasi atau jumlah tempat dari mana bakteri itu ditemukan. Bilah kesalahan menunjukkan kesalahan standar

Gambar ukuran penuh

Ketika kelompok umur dipertimbangkan, S. pneumoniae dibawa secara signifikan lebih banyak pada anak usia 0–4 tahun (P < 0. 05) (Gbr. 3), dan ada lebih banyak H. influenzae diisolasi dari mereka yang berusia 5–17 tahun dibandingkan anak di bawah 5 tahun dan orang dewasa (P < 0. 05). K. pneumoniae dibawa secara signifikan lebih banyak pada orang dewasa daripada anak-anak (P < 0. 05)

Dari 21 pneumokokus yang diisolasi, 33. 3% (n = 7) adalah PCV13 VT (6B, 14, 18C dan 3), 14. 3% (n = 3) adalah PCV10 VT (6B, 14 dan 18C) dan 28. 6% (n = 6) adalah jenis non-vaksin (NVT) (6C, 7C, 10A, 11C dan 35A) (Gambar. 4). 38 terakhir. 1% (n = 8) tidak dapat diserotipe

ara. 4

Serotipe dari S. pneumonia terisolasi. Plot batang menunjukkan jumlah yang diamati untuk setiap serotipe yang diidentifikasi untuk 21 isolat pneumokokus yang dikumpulkan dari orofaring, nasofaring, hidung dan mulut peserta yang direkrut dari komunitas pedesaan di Sarawak, Malaysia pada April 2016. N.D. Tidak ditentukan. PCV. vaksin konjugat pneumokokus, NVT. Jenis non-vaksin. Keduanya serotipe 3 S. pneumoniae diisolasi dari peserta yang sama, satu dari nasofaring yang lain dari orofaring. Dua dari serotipe 7C S. pneumoniae diisolasi dari peserta yang sama, satu dari nasofaring yang lain dari hidung. Keduanya serotipe 10A S. pneumoniae diisolasi dari peserta yang sama, satu dari nasofaring yang lain dari hidung. 6 dari S yang tidak diketik. pneumoniae diisolasi dari 3 peserta dengan masing-masing memiliki S. pneumoniae diisolasi dari nasofaring dan hidung

Gambar ukuran penuh

Semua S. aureus diidentifikasi sensitif terhadap methicillin. Ketika menilai kerentanan antibiotik isolat bakteri menggunakan cakram antibiotik dan strip MIC, kerentanan berkisar antara 33. 3–100% tergantung pada spesies dan antibiotik (Gbr. 5). Kecuali S. pneumoniae, semua isolat dari setiap spesies bakteri rentan terhadap setidaknya satu jenis antibiotik (mis. g. semua H. influenzae rentan terhadap ciprofloxacin), sementara semua isolat bakteri, terlepas dari spesiesnya, rentan terhadap satu atau lebih antibiotik yang diuji. Dari 21 S. pneumonia terisolasi, 47. 6% (n = 10) resisten terhadap setidaknya satu antibiotik dan 23. 8% (n = 5) resisten terhadap dua antibiotik. Tidak ada yang resisten terhadap tiga atau lebih antibiotik. Dari 19 H. influenzae diisolasi, 52. 6% (n = 10) resisten terhadap setidaknya satu antibiotik dan tidak ada yang resisten terhadap dua atau lebih antibiotik. Dari 42 S. aureus diisolasi, 66. 7% (n = 28) resisten terhadap setidaknya satu antibiotik, 28. 6% (n = 12) resisten terhadap setidaknya dua antibiotik dan 2. 3% (n=1) resisten terhadap tiga antibiotik. Dari 17 M. catarrhalis terisolasi tidak ada yang resisten terhadap antibiotik yang diuji. Dari 58 K. pneumonia terisolasi, 8. 6% (n = 5) resisten terhadap setidaknya satu antibiotik dan tidak ada yang resisten terhadap dua atau lebih antibiotik. Secara keseluruhan, 33. 8% (n = 53) dari semua bakteri yang diisolasi dan diuji (n = 157) resisten terhadap setidaknya satu antibiotik, 10. 8% (n = 17) untuk setidaknya dua antibiotik dan 0. 6% (n = 1) untuk tiga antibiotik. Prevalensi resistensi tertinggi diamati untuk S. aureus dengan 66. 7% resisten terhadap benzilpenisilin. Hal ini diikuti oleh H. resistensi influenzae terhadap benzilpenisilin (52. 6%) dan S. pneumoniae menjadi eritromisin (28. 6%)

ara. 5

Resistensi antimikroba dari bakteri yang diisolasi. Plot batang persentase menunjukkan AMR dari semua 157 S. pneumoniae, H. influenzae, K. pneumoniae, S. aureus dan M. catarrhalis dikumpulkan dari penduduk pedesaan di Sarawak, Malaysia pada April 2016. Disk antibiotik dan strip MIC digunakan dan breakpoint EUCAST digunakan untuk menilai kerentanan dan resistensi

Gambar ukuran penuh

Diskusi

Studi ini bertujuan untuk mengatasi kekurangan data epidemiologis yang dipublikasikan di Malaysia, dengan meningkatkan pengetahuan kita tentang profil pembawa dan AMR dari patogen URT yang umum. Ini telah memberikan data penting mengenai epidemiologi bakteri di bagian populasi Malaysia yang kurang dipelajari. Serta perspektif yang tak ternilai mengenai potensi tantangan infeksi dan pengendalian AMR pada populasi tersebut, yang terisolasi pada tingkat yang berbeda-beda dari populasi Malaysia yang lebih luas dan/atau berbeda secara sosio-ekonomi dari mereka yang tinggal di kota-kota besar atau Semenanjung Malaysia karena gaya hidup pedesaan atau rumah panjang mereka. Di Malaysia epidemiologi patobion URT kurang dipahami dan karena itu akan mendapat manfaat dari studi berbasis populasi skala besar lebih lanjut untuk menginformasikan kebijakan vaksin, untuk memantau efek implementasi vaksin dan memberikan pemahaman tentang prevalensi AMR untuk menginformasikan pengobatan infeksi [ 22]

Studi ini memberikan kesempatan khusus untuk menyelidiki patogen ESKAPE seperti K. pneumoniae, yang morbiditas dan mortalitasnya dikaitkan dengan peningkatan munculnya AMR [12]. Pengawasan lebih lanjut diperlukan untuk memantau perubahan prevalensi pengidap, munculnya serotipe baru dan AMR [23]. Kami menemukan K. pneumoniae untuk dibawa secara signifikan lebih banyak pada orang dewasa, yang sebanding dengan temuan dari Indonesia [24], namun pengangkutan K. pneumoniae di sini lebih dari dua kali lipat yang dilaporkan sebelumnya di Indonesia, Vietnam, Brazil dan Minnesota, USA (antara 3 dan 15%) [24,25,26,27]. Hal ini penting karena pembawaan merupakan faktor risiko infeksi dan K. pneumoniae adalah penyebab umum CAP dan gejala sisa yang serius seperti sepsis dan meningitis [25, 28]. K. pneumoniae semakin memprihatinkan karena munculnya strain yang resistan terhadap berbagai obat terkait dengan wabah di rumah sakit dan infeksi parah yang didapat dari masyarakat. Antibiotik pertahanan lini terakhir dengan cepat menjadi tidak efektif [29]. Meskipun demikian, isolat yang diperoleh dalam penelitian ini menunjukkan prevalensi AMR yang rendah, dan tidak ada yang resisten terhadap berbagai obat. Sementara hanya empat antibiotik yang diuji, yang dipilih adalah yang paling relevan secara klinis berdasarkan pedoman resep di Malaysia. Meskipun keduanya tertarik dan mempublikasikan data klinis untuk K. pneumoniae telah meningkat, sedikit yang telah dipublikasikan tentang AMR isolat pembawa. Sebuah studi sebelumnya menemukan 29% isolat pembawa URT memiliki resistansi terhadap dua antibiotik yang diuji, dengan 100% isolat resisten terhadap ampisilin [30]. Meskipun K. pneumoniae dianggap sebagai bakteri penghasil extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) [31], tingkat kerentanan antibiotik yang tinggi ditemukan, bahkan terhadap antibiotik β-laktam [30], yang konsisten dengan temuan penelitian ini

Pengangkutan S. aureus konsisten dengan 23. Prevalensi keretakan sebesar 4% sebelumnya ditemukan di Semenanjung Malaysia [32]. Karena kurangnya data, prevalensi pengangkutan S. pneumoniae, H. influenzae dan M. catarrhalis di Malaysia tidak jelas. Data pengangkutan anak usia dini di Indonesia menunjukkan 49. 5, 27. 5 dan 42. Prevalensi 7% untuk S. pneumoniae, H. influenzae dan M. catarrhalis masing-masing [33]. Karena ukuran sampel yang kecil dari kelompok usia ini dalam penelitian kami, prevalensi pengangkutan bakteri ini tidak tepat; . 21. 8–78. 2%), 0% (95CI. 0. 0–26. 5%), dan 25% (95CI. 0. 60–49. 4%) untuk S. pneumoniae, H. influenzae dan M. katarak masing-masing. Penelitian lebih lanjut akan berguna di semua kelompok umur

Sementara penelitian kami menemukan 33. 3% dari membawa S. serotipe pneumoniae menjadi PCV13 VT dan 14. 3% PCV10 VT, studi dari Semenanjung Malaysia menunjukkan proporsi yang lebih tinggi dari S. pneumoniae VT carriage, hingga 69. 5% menjadi PCV13 VT dan 40. 6% menjadi PCV10 dan PCV7 VT [34, 35]. Tentu saja, VT S. pneumoniae menyebabkan sebagian besar penyakit pneumokokus di Semenanjung Malaysia dengan 66. 3% RTI pada anak disebabkan oleh PCV13 VT dan 60% oleh PCV10 VT [36]. Karena PCV13 serotipe 1, 6B, 14, 19F, 19A umumnya dikaitkan dengan penyakit di Malaysia [10, 37], pengangkutan 6B dan 14 (pada anak-anak) di sini menarik untuk kesehatan masyarakat, terutama karena serotipe ini termasuk dalam PCV10 dan PCV13. Namun, karena hanya 21 isolat S. pneumoniae pulih, kesimpulan terbatas dapat ditarik, terutama karena banyak yang tetap tidak bertipe. Namun, karena cakupan PCV dari isolat invasif di Malaysia telah dilaporkan setinggi 88. 2% untuk PCV13 dan 64. 1% untuk PCV10 Penyerapan PCV secara luas sebagai bagian dari pembaruan NIP yang direncanakan memiliki potensi tinggi untuk mengurangi penyakit [10, 38]

AMR adalah masalah yang semakin meningkat di seluruh Asia; . pneumoniae dan K. pneumoniae menjadi perhatian khusus [17, 36, 39, 40]. Di Malaysia, antibiotik umumnya diresepkan untuk pengobatan infeksi saluran kemih, meskipun pilihan dan dosis antibiotik yang tidak tepat telah ditunjukkan pada 40% kasus. Ini penting, karena penyalahgunaan antibiotik merupakan kekuatan selektif yang signifikan untuk perkembangan AMR. Eritromisin dan penisilin adalah yang paling sering diresepkan dan paling sering diresepkan secara berlebihan atau salah [41]. Mereka juga merupakan antibiotik yang terbukti memiliki tingkat resistensi tertinggi dalam penelitian ini. Selain itu, data menunjukkan 55% orang Malaysia menghentikan pengobatan antibiotik ketika gejala hilang, daripada menyelesaikan pengobatan lengkap seperti yang ditentukan. Penyalahgunaan tersebut merupakan faktor risiko yang signifikan untuk pengembangan AMR dan paling umum di masyarakat daripada pengaturan rumah sakit [42]. Untuk mengurangi penyalahgunaan antibiotik, pendidikan tentang risiko AMR diberikan sesuai dengan Rencana Aksi Malaysia untuk Resistensi Antimikroba (MyAP-AMR) [23, 42]

Data AMR kami kontras dengan penelitian sebelumnya di Semenanjung Malaysia; . 7% (n = 28) dari S. aureus resisten terhadap benzilpenisilin dibandingkan dengan 100% yang terlihat sebelumnya [43]. Resistensi eritromisin pada S. pneumoniae sebanding dengan yang dari penyakit dalam studi Peninsular Malaysia (28. 6% berbanding 35. 8%) sedangkan resistensi tetrasiklin lebih rendah (19. 1% berbanding 38. 7%) [44]

Keterbatasan utama dari penelitian ini adalah perekrutan yang terbatas, terutama pada anak-anak, yang berarti beberapa prevalensi karier memiliki interval kepercayaan yang lebar. Rekrutmen anak yang rendah diperparah dengan tidak semua anak memberikan swab NP atau OP. Dari 40 anak yang direkrut, hanya 32 yang menyediakan swab NP dan 29 yang menyediakan swab OP; . Beberapa faktor menyebabkan perekrutan yang rendah. Di Rumah Numpang dan Rumah Bana, sebagian besar masyarakat (khususnya laki-laki) tinggal jauh untuk bekerja/belajar dan hanya kembali pada akhir pekan, sementara yang lain tinggal berbulan-bulan. Selain itu, beberapa penduduk menghindari daerah yang menjadi tempat tim peneliti untuk merekrut untuk menghindari interaksi dengan peneliti/keikutsertaan dalam penelitian (Long Nen), sementara lokasi lain adalah komunitas yang sangat kecil (Ba Marong hanya terdiri dari dua keluarga besar). Studi ini bagaimanapun menginformasikan kelayakan melakukan penelitian tersebut. Cara untuk meningkatkan rekrutmen seperti kebutuhan untuk mengunjungi lebih banyak lokasi atau melakukan kunjungan berulang ke lokasi telah diidentifikasi. Meskipun sulit bagi beberapa komunitas, khususnya yang paling terisolasi, penulis akan merekomendasikan peningkatan keterlibatan komunitas sebelum kunjungan penelitian. Meskipun Universitas memiliki hubungan dengan beberapa komunitas dan terlibat dengan para pemimpin sebelum penelitian, peningkatan keterlibatan dapat meningkatkan kepercayaan dari warga masyarakat, mengurangi penghindaran peneliti. Ini juga memungkinkan peneliti untuk memiliki kesadaran yang lebih baik tentang waktu terbaik untuk berkunjung ketika sebagian besar penduduk kemungkinan akan hadir

Keterbatasan muncul selama transportasi penyeka, pertama karena fluktuasi suhu antara pengambilan sampel dan kedatangan di laboratorium Inggris karena kondisi transportasi tanpa pendingin. Selama perekrutan dan pengambilan sampel, penyeka bekas disimpan dalam kotak terisolasi dengan es untuk menjaga suhu tetap rendah; . Di markas ekskursi dan selama pengangkutan kurir darat, penyeka disimpan di gedung dan van ber-AC sehingga suhu tetap di bawah 21 °C. Pada penerbangan dari Malaysia ke Inggris, suhunya jauh lebih rendah (kurang dari 10 °C), sedangkan transportasi darat di Inggris cenderung tetap antara 2 dan 15 °C. Meskipun demikian, kisaran suhu penyimpanan swab sesuai dengan kondisi kontrol kualitas yang diuji di bawah Institut Standar Laboratorium Klinis (CLSI) Standar yang Disetujui M40-A2 [45]. Semua penyeka yang digunakan dalam penelitian ini adalah CLSI Approved Standard M40-A2, yang memastikan jumlah bakteri tidak akan berkurang lebih dari 3 log10 di bawah suhu pendinginan dan lingkungan (2–30 °C) atau meningkat lebih dari 1 log10 pada suhu pendinginan, selama periode penahanan 48 jam. Keterbatasan kedua terkait transportasi swab adalah waktu antara pengambilan sampel dan swab diproses di laboratorium. Karena transportasi memakan waktu 3–5 hari, ada kemungkinan bahwa prevalensi pengidap yang terlihat di sini mungkin diremehkan karena beberapa bakteri tidak dapat bertahan dalam transportasi. Tentu saja, kondisi pengangkutan akan mengurangi kelangsungan hidup bakteri, dan mungkin telah mempengaruhi beberapa spesies yang kurang tangguh daripada yang lain. Studi selanjutnya akan mendapat manfaat dari penggunaan pengirim kering, yang akan mengatasi masalah fluktuasi suhu dan penundaan transportasi. Selain itu, akan bermanfaat untuk segera menyimpan sampel swab di STGG saat berada di lapangan, daripada menunggu hingga swab diterima oleh laboratorium. Hal ini selanjutnya akan memfasilitasi pembekuan/penggunaan pengirim kering sebelum transportasi

Kebutuhan untuk mengangkut penyeka ke laboratorium yang berbasis di Inggris disebabkan oleh kurangnya kapasitas pada saat analisis mikroba di lembaga kolaborasi lokal. Ini mendukung pembangunan penelitian dan kapasitas laboratorium di Malaysia

Karena pengurutan seluruh genom tidak dimungkinkan dalam penelitian ini, banyak (38. 1%, n = 8) Q. pneumoniae tetap tidak bertipe; . pneumoniae (kekurangan kapsul), adalah serotipe baru, atau serotipe tipikal yang tidak dapat diketik dengan metodologi aglutinasi yang digunakan. Data tersebut akan memberikan kontribusi untuk pemahaman lebih lanjut manfaat potensial dari serapan PCV secara luas di Malaysia dan dengan demikian akan dimasukkan dalam penelitian masa depan.

Kesimpulan

Studi ini melaporkan data baru pada bagian populasi Malaysia yang belum dipelajari, memberikan wawasan penting ke dalam profil epidemiologi dan AMR dari patogen pernapasan umum yang terkait dengan pneumonia.

Ketersediaan data dan bahan

Kumpulan data yang digunakan dan/atau dianalisis selama penelitian ini tersedia dari penulis terkait berdasarkan permintaan yang masuk akal

Referensi

1. Beban Penyakit Global 2016 Penyebab Kematian Kolaborator. Kematian spesifik usia-jenis kelamin global, regional, dan nasional untuk 264 penyebab kematian, 1980–2016. analisis sistematis untuk Global Burden of Disease Study 2016. Lanset. 2017;390(10100). 1151–210

   Artikel Google Cendekia

2. Statistik Penyebab Kematian, Malaysia, 2018 [siaran pers]. Malaysia. Departemen Statistik Malaysia, 31 Oktober 2018 2018

3. Azmi S, Aljunid SM, Maimaiti N, Ali A-A, Muhammad Nur A, De Rosas-Valera M, dkk. Menilai beban pneumonia menggunakan data administrasi dari Malaysia, Indonesia, dan Filipina. Int J Menginfeksi Dis. 2016; 49. 87–93. https. //doi. org/10. 1016/j. ijid. 2016. 05. 021

   Artikel PubMed Google Cendekia

4. Garcia-Vidal C, Fernandez-Sabe N, Carratala J, Diaz V, Verdaguer R, Dorca J, dkk. Kematian dini pada pasien dengan pneumonia komunitas. penyebab dan faktor resiko. Eur Respir J. 2008;32(3). 733–9. https. //doi. org/10. 1183/09031936. 00128107

5. Limper AH. 97 - ikhtisar pneumonia. Di. Goldman L, Schafer AI, editor. Obat Cecil Goldman (edisi kedua puluh empat). Philadelphia. W. B. Saunders; . p. 587–96. https. //doi. org/10. 1016/B978-1-4377-1604-7. 00097-X

   Bab Google Cendekia

6. GBD 2016 Kolaborator Infeksi Saluran Pernapasan Bawah, dkk. Lancet Menginfeksi Dis. 2018;18(11). 1191–210

   Artikel Google Cendekia

7. Organisasi Kesehatan Dunia. Estimasi WHO-UNICEF cakupan PCV3 2019 [dikutip 2020 01/03/2020]. tersedia dari. http. //aplikasi. siapa. int/immunization_monitoring/globalsummary/timeseries/tswucoveragepcv3. html

   beasiswa Google

8. Organisasi Kesehatan Dunia dan Basis Data Vaksin dan Biologi Imunisasi. Vaksin dalam Update Program Imunisasi Nasional. 2020 [diperbarui Juni 2020; . tersedia dari. http. // www. siapa. int/immunization/monitoring_surveillance/VaccineIntroStatus. pptx

   beasiswa Google

9. Ko Chung Sen, DAP Malaysia. Anggaran 2020 mencapai vaksinasi pneumokokus universal sebesar 10% dari biaya 2019 [Tersedia dari. https. //dapmalaysia. org/pernyataan/2019/10/13/29124/

   beasiswa Google

10. Jauneikaite E, Jefferies JM, Hibberd ML, Clarke SC. Prevalensi serotipe Streptococcus pneumoniae yang menyebabkan penyakit invasif dan non-invasif di Asia Tenggara. ulasan. Vaksin. 2012;30(24). 3503–14. https. //doi. org/10. 1016/j. vaksin. 2012. 03. 066

    Artikel CAS PubMed Google Scholar

11. Cilloniz C, Dominedo C, Torres A. Bakteri gram negatif yang resistan terhadap berbagai obat pada pneumonia yang didapat masyarakat. Perawatan Kritis. 2019;23(1). 79. https. //doi. org/10. 1186/s13054-019-2371-3

    Artikel PubMed PubMed Central Google Scholar

12. McNeil HC, Lean SS, Lim V, Clarke SC. Negara bagian ESKAPE di Malaysia. Agen Antimikroba Int J. 2016;48(5). 578–9. https. //doi. org/10. 1016/j. ijantimicag. 2016. 08. 011

    Artikel CAS PubMed Google Scholar

13. Chalmers J, Campling J, Ellsbury G, Hawkey PM, Madhava H, Slack M. Pneumonia yang didapat masyarakat di Inggris. panggilan untuk bertindak. Pneumonia (Nathan Qld). 2017; 9. 15

    Artikel Google Cendekia

14. Prina E, Ranzani OT, Torres A. Pneumonia yang didapat masyarakat. Lanset. 2015;386(9998). 1097–108. https. //doi. org/10. 1016/S0140-6736(15)60733-4

    Artikel PubMed PubMed Central Google Scholar

15. Chung DR, Song JH, Kim SH, Thamlikitkul V, Huang SG, Wang H, dkk. Prevalensi tinggi nonfermentor yang resistan terhadap berbagai obat pada pneumonia yang didapat di rumah sakit di Asia. Am J Respir Crit Care Med. 2011;184(12). 1409–17. https. //doi. org/10. 1164/rccm. 201102-0349OC

16. Liam CK, Lim KH, Wong CM. Pneumonia yang didapat masyarakat pada pasien yang membutuhkan rawat inap. Respirologi. 2001;6(3). 259–64. https. //doi. org/10. 1046/j. 1440-1843. 2001. 00336. x

    Artikel CAS PubMed Google Scholar

17. Wyres KL, Nguyen TNT, Lam MMC, Judd LM, van Vinh CN, Dance DAB, dkk. Pengawasan genomik untuk hipervirulensi dan resistensi multi-obat pada Klebsiella pneumoniae invasif dari Asia selatan dan Tenggara. Genom Medis. 2020;12(1). 11. https. //doi. org/10. 1186/s13073-019-0706-y

    Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

18. Organisasi Kesehatan Dunia. Estimasi WHO-UNICEF tentang cakupan Hib3 2019 [dikutip 2020 03/01/2020]. tersedia dari. http. //aplikasi. siapa. int/immunization_monitoring/globalsummary/timeseries/tswucoveragehib3. html

    beasiswa Google

19. McNeil HC, Jefferies JM, Clarke SC. Meningitis yang dapat dicegah dengan vaksin di Malaysia. epidemiologi dan penatalaksanaan. Pakar Rev Anti-Infect Ther. 2015;13(6). 705–14. https. //doi. org/10. 1586/14787210. 2015. 1033401

    Artikel CAS PubMed Google Scholar

20. Simell B, Auranen K, Kayhty H, Goldblatt D, Dagan R, O'Brien KL, dkk. Hubungan mendasar antara pembawa pneumokokus dan penyakit. Tinjauan Pakar tentang Vaksin. 2012;11(7). 841–55. https. //doi. org/10. 1586/erv. 12. 53

    Artikel CAS PubMed Google Scholar

21. Vincent JR, Ali RM. Mengelola kekayaan alam. lingkungan dan pembangunan di Malaysia. Washington DC. C. Singapura. Pers RFF;

    beasiswa Google

22. McNeil HC, Clarke SC. Prevalensi serotipe Streptococcus pneumoniae di Malaysia - kebutuhan untuk studi kereta. MedJ Malaysia. 2016;71(3). 134–8

    CAS  PubMed  Google Cendekia

23. Kementerian Kesehatan Malaysia. Rencana Aksi Malaysia untuk Resistensi Antimikroba (MyAP-AMR) 2017-2021. Unit pengendalian infeksi, Bagian Kualitas Perawatan Medis, Divisi Pengembangan Medis, Kementerian Kesehatan Malaysia, vol. 2018. p. 20–34

24. Farida H, Severin JA, Gasem MH, Keuter M, van den Broek P, Hermans PW, dkk. Pengangkutan nasofaring Klebsiella pneumoniae dan basil gram negatif lainnya pada kelompok usia rawan pneumonia di Semarang, Indonesia. Mikrobiol J Clinic. 2013;51(5). 1614–6. https. //doi. org/10. 1128/JCM. 00589-13

    Artikel PubMed PubMed Central Google Scholar

25. Dao TT, Liebenthal D, Tran TK, Ngoc Thi Vu B, Ngoc Thi Nguyen D, Thi Tran HK, Thi Nguyen CK, Thi Vu HL, Fox A, Horby P, van Nguyen K, Wertheim HFL Klebsiella pneumoniae kereta orofaring di pedesaan dan perkotaan Vietnam dan pengaruh konsumsi alkohol. PLoS Satu 2014;9(3). e91999, https. //doi. org/10. 1371/jurnal. roti manis. 0091999

26. Lima ABM, Leão LSNdO, Oliveira LSdC, Pimenta FC. Kolonisasi basil gram negatif nasofaring pada anak-anak Brasil yang menghadiri pusat penitipan anak. Mikrobiol Braz J. 2010;41(1). 24–7. https. //doi. org/10. 1590/S1517-83822010000100005

    Artikel PubMed PubMed Central Google Scholar

27. Wolf B, Rey LC, Moreira LB, Milatovic D, Fleer A, Verhoef J, dkk. Pengangkutan basil gram negatif pada anak-anak muda Brasil dengan pneumonia yang didapat masyarakat. Int J Menginfeksi Dis. 2001;5(3). 155–9. https. //doi. org/10. 1016/S1201-9712(01)90091-8

28. Paczosa MK, Mecsas J. Klebsiella pneumoniae. melakukan serangan dengan pertahanan yang kuat. Mikrobiol Mol Biol Rev. 2016;80(3). 629–61. https. //doi. org/10. 1128/MMBR. 00078-15

    Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

29. Holt KE, Wertheim H, Zadoks RN, Baker S, Whitehouse CA, Dance D, dkk. Analisis genom keragaman, struktur populasi, virulensi, dan resistensi antimikroba di Klebsiella pneumoniae, ancaman mendesak bagi kesehatan masyarakat. Proc Natl Acad Sci USA. 2015;112(27). E3574–81. https. //doi. org/10. 1073/pna. 1501049112

30. Gorrie CL, Mirceta M, Wick RR, Judd LM, Wyres KL, Thomson NR, dkk. Pengangkutan dan infeksi Klebsiella pneumoniae yang kebal antimikroba di bangsal perawatan geriatri khusus terkait dengan Akuisisi di Rumah Sakit Perujuk. Klinik Menginfeksi Dis. 2018;67(2). 161–70. https. //doi. org/10. 1093/cid/ciy027

31. Ferreira RL, BCM d S, Rezende GS, Nakamura-Silva R, Pitondo-Silva A, Campanini EB, dkk. Prevalensi Tinggi Klebsiella pneumoniae yang Tahan terhadap Berbagai Obat yang Menyimpan Beberapa Virulensi dan Gen Pengkode β-Laktamase di Unit Perawatan Intensif Brasil. Mikrobiol Depan. 2019;9(3198)

32. Choi CS, Yin CS, Bakar AA, Sakewi Z, Naing NN, Jamal F, dkk. Pengangkutan hidung Staphylococcus aureus di antara orang dewasa yang sehat. J Mikrobiol Immunol Menginfeksi. 2006;39(6). 458–64

    PubMed Google Cendekia

33. Dunne EM, Murad C, Sudigdoadi S, Fadlyana E, Tarigan R, Indriyani SAK, dkk. Pembawa Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, dan Staphylococcus aureus pada anak Indonesia. sebuah studi cross-sectional. PLoS Satu. 2018;13(4). e0195098. https. //doi. org/10. 1371/jurnal. roti manis. 0195098

34. Yatim MM, Masri SN, Desa MNM, Taib NM, Nordin SA, Jamal F. Penentuan fenotipe dan protein permukaan pneumokokus jenis keluarga Streptococcus pneumoniae dari anak sehat Malaysia. J Mikrobiol Immunol Menginfeksi. 2013;46(3). 180–6. https. //doi. org/10. 1016/j. Hmm. 2012. 04. 004

    Artikel CAS PubMed Google Scholar

35. Cleary DW, Morris DE, Anderson RA, Alattraqchi AG, Rahman NIA, Ismail S, dkk. Mikrobioma saluran pernapasan bagian atas Orang Asli asli di timur laut Semenanjung Malaysia. medRxiv. 2020; 2020. 06. 02. 20120444

    beasiswa Google

36. Goh SL, Kee BP, Abdul Jabar K, Chua KH, Nathan AM, Bruyne J, dkk. Deteksi molekuler dan karakterisasi genotipik Streptococcus pneumoniae diisolasi dari anak-anak di Malaysia. Kesehatan Glob Pathog. 2020. 1–9

37. Subramaniam P, Jabar KA, Kee BP, Chong CW, Nathan AM, de Bruyne J, dkk. Kerentanan serotipe & penisilin terhadap Streptococcus pneumoniae yang diisolasi dari anak-anak yang dirawat di rumah sakit pendidikan tersier di Malaysia. India J Med Res. 2018;148(2). 225–31. https. //doi. org/10. 4103/ijmr. IJMR_1987_16

38. Arushothy R, Ahmad N, Amran F, Hasyim R, Samsudin N, Azih CRC. Distribusi serotipe pneumokokus dan kerentanan antibiotik di Malaysia. studi empat tahun (2014-2017) pada isolat pediatrik invasif. Int J Menginfeksi Dis. 2019; 80. 129–33. https. //doi. org/10. 1016/j. ijid. 2018. 12. 009

    Artikel PubMed Google Cendekia

39. Song J, Jung S, Ko K, KN, son J, Chang H, dkk. tingginya prevalensi resistensi antimikroba di antara isolat Streptococcus pneumoniae klinis di Asia (studi ANSORP). Kemoterapi Agen Antimikroba. 2004;48(6). 2101–7. https. //doi. org/10. 1128/AAC. 48. 6. 2101-2107. 2004

    Artikel CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

40. Mustafa M, Yusof I, Rahman M, Sein M, Tan T. Pneumonia terkait perawatan kesehatan. diagnosis patogenesis dan pencegahan. Farmasi IOSR J. 2014;4(12). 47–52

    beasiswa Google

41. Tan G-H, Q-W Rendah, Lim H-C, Seah H-K, Chan H-K. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat. tinjauan resep rawat jalan dari Rumah Sakit sekunder regional di Kedah, Malaysia. J Pharm Pract Community Med. 2017;3(4). 215–9. https. //doi. org/10. 5530/jppcm. 2017. 4. 62

    Artikel Google Cendekia

42. Fatokun O. Menjelajahi penggunaan dan praktik antibiotik di komunitas Malaysia. Farmasi Klinik Int J. 2014;36(3). 564–9. https. //doi. org/10. 1007/s11096-014-9937-6

    Artikel PubMed Google Cendekia

43. Zarizal S, Yeo CC, Faizal GM, Chew CH, Zakaria ZA, Jamil Al-Obaidi MM, dkk. Kolonisasi hidung, kerentanan antimikroba dan pola genotipik Staphylococcus aureus di antara mahasiswa bioteknologi pertanian di Besut, Terengganu, pantai timur Malaysia. Kesehatan Tropis Med Int. 2018;23(8). 905–13. https. //doi. org/10. 1111/tmi. 13090

    Artikel CAS Google Cendekia

44. Yasin RM, Zin NM, Hussin A, Nawi SH, Hanapiah SM, Wahab ZA, dkk. Tren distribusi serotipe pneumokokus dan pola kerentanan antibiotik saat ini di rumah sakit Malaysia. Vaksin. 2011;29(34). 5688–93. https. //doi. org/10. 1016/j. vaksin. 2011. 06. 004

45. Institut Standar Laboratorium Klinis. Kontrol kualitas sistem transportasi mikrobiologi; . Dokumen CLSI M40-A2. Wayne, PA. Lembaga Standar Klinis dan Laboratorium;

    beasiswa Google

Unduh referensi

Terima kasih

Penulis berterima kasih kepada Prof Mak Joon Wah atas kontribusi ilmiah dan dukungannya

Kami berterima kasih kepada Winston Yap, Ann Yap, Jason Chin, Victor Lim, Susiana Chelz Macha dan Audrey Yap atas bantuan mereka dalam transportasi, rekrutmen, pengambilan sampel dan penerjemahan

Kami berterima kasih kepada Departemen Mikrobiologi di Rumah Sakit Queen Alexandra Portsmouth yang melakukan MALDI-TOF untuk mengonfirmasi dugaan K. isolat pneumonia

Kami juga berterima kasih kepada setiap komunitas dan sesepuh/tokoh masyarakat yang mengizinkan kami untuk berkunjung. Kami terutama berterima kasih kepada mereka yang berpartisipasi dalam penelitian ini

Pendanaan

Pekerjaan ini didanai oleh penghargaan Newton Fund Institutional Links kepada Dr. Stuart C Clarke dan Prof Mohd Nor Norazmi [nomor hibah 172686537];

Informasi penulis

Penulis dan Afiliasi

1. Fakultas Kedokteran dan Institut Ilmu Hayati, University of Southampton, Southampton, Inggris

   Denise E. Morris, Hannah McNeil, Rebecca E. Hocknell, Rebecca Anderson, Andrew C. Tuck, Serena Tricarico, David W. Cleary & Stuart C. Clarke

2. Sekolah Ilmu Kesehatan, Universiti Sains Malaysia, Kubang Kerian, Kelantan, Malaysia

   Mohd Nor Norazmi

3. Fakultas Kedokteran, Universitas Kedokteran Internasional, Kuala Lumpur, Malaysia

   Victor Lim & Patricia Kim Chooi Lim

4. Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan, Universiti Malaysia Sarawak, Kota Samarahan, Sarawak, Malaysia

   Tan Cheng Siang

5. Institut Penelitian, Pengembangan dan Inovasi, Universitas Kedokteran Internasional, Kuala Lumpur, Malaysia

   Patricia Kim Chooi Lim, Chong Chun Wie, Ivan Kok Seng Yap & Stuart C. Clarke

6. Sekolah Farmasi, Universitas Monash Malaysia, Bandar Sunway, Selangor, Malaysia

   Chong Chun Wie

7. Pusat Penelitian Biomedis NIHR Southampton, University Hospital Southampton Foundation NHS Trust, Southampton, Inggris

   David W. Cleary & Stuart C. Clarke

8. Dewan Penelitian dan Pengembangan Sarawak, Kuching, Sarawak, Malaysia

   Ivan Kok Seng Yap

9. Institut Penelitian Kesehatan Global, Universitas Southampton, Southampton, Inggris

   Stuart C. Clarke

Penulis

1. Denise E. Morris

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

2. Hannah McNeil

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

3. Rebecca E. Hocknell

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

4. Rebecca Anderson

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

5. andrew c. Menyelipkan

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

6. Serena Tricarico

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

7. Mohd Nor Norazmi

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

8. Victor Lim

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

9. Tan Cheng Siang

   Lihat publikasi penulis

   Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

10. Patricia Kim Chooi Lim

    Lihat publikasi penulis

    Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

11. Chong Chun Wie

    Lihat publikasi penulis

    Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

12. David W. Jelas

    Lihat publikasi penulis

    Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

13. Ivan Kok Seng Yap

    Lihat publikasi penulis

    Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

14. Stuart C. Clarke

    Lihat publikasi penulis

    Anda juga dapat menelusuri penulis ini di PubMed   Google Cendekia

Konsorsium

atas nama grup MYCarriage

• Koh Kwee Choy
• , Stuart C. Clarke
• , David W. Jelas
• , C. Patrick Doncaster
• , Saulus N. Faust
• , Eddy Cheah Seong Guan
• , Wong Chin Hoong
• , Aziah Ismail
• , Johanna M. C. Jefferies
• , Alex R. Kraaijeveld
• , Victor Lim
• , Nuala McGrath
• , Michael Moore
• , Marie-Louise Newell
• , Mohd Nor Norazmi
• , Paul Roderick
• , Ivan Yap Kok Seng
• , Cheng Siang Tan
• , Jeremy S. Webb
• , Chong Chun Wie
• & Ho Ming Yuen

Kontribusi

DEM - analisis formal, investigasi, kurasi data, penulisan draf asli, review & editing, visualisasi dan administrasi proyek. HM - investigasi, kurasi data, review & editing, pengawasan dan administrasi proyek. REH - analisis formal, kurasi data, penulisan draf asli dan visualisasi. RA - investigasi, kurasi data, review & editing dan administrasi proyek. ACT - investigasi dan review & editing. ST - investigasi, kurasi data, dan peninjauan & pengeditan. MNN - metodologi, penulisan - review & editing dan akuisisi pendanaan. VL - metodologi, review & editing dan akuisisi pendanaan. TCS - metodologi, review & editing dan akuisisi pendanaan. PKCL - review & editing dan akuisisi pendanaan. CCW - metodologi, investigasi, review & editing dan akuisisi pendanaan. DWC - investigasi, review & editing dan supervisi. IKSY - metodologi, investigasi, sumber daya, review & editing, supervisi, administrasi proyek dan akuisisi pendanaan. SCC - konseptualisasi, metodologi, sumber daya, tinjauan & pengeditan, pengawasan, administrasi proyek, dan akuisisi pendanaan. Grup MYCarriage - ulasan & pengeditan. Penulis (s) membaca dan menyetujui naskah akhir

Penulis yang sesuai

Korespondensi ke Stuart C. Clarke

Deklarasi etika

Persetujuan etika dan persetujuan untuk berpartisipasi

Persetujuan etis diberikan oleh Komite Bersama International Medical University Malaysia (IMU) untuk Riset dan Etika (ID Proyek No. IMU R 175/2015) dan Komite Etika Fakultas Kedokteran Universitas Southampton (Submission ID. 14478). Difasilitasi oleh penerjemah, proses untuk mendapatkan persetujuan diikuti untuk semua peserta, dengan orang tua/wali memberikan persetujuan untuk mereka yang berusia di bawah 18 tahun. Partisipasi melibatkan membaca dan memahami lembar informasi studi dan melengkapi formulir persetujuan dan kuesioner. Dalam kasus melek huruf yang buruk, dokumen studi dibacakan kepada peserta, dan formulir persetujuan ditandatangani dengan kemampuan terbaik peserta dengan dukungan dari anggota keluarga yang melek huruf.

Kepentingan yang bersaing

SCC bertindak sebagai penyelidik utama dalam studi yang dilakukan atas nama University Hospital Southampton NHS Foundation Trust/University of Southampton yang disponsori oleh produsen vaksin tetapi tidak menerima pembayaran pribadi dari mereka. SCC telah berpartisipasi dalam dewan penasihat untuk produsen vaksin tetapi tidak menerima pembayaran pribadi untuk pekerjaan ini. SCC telah menerima bantuan keuangan dari produsen vaksin untuk menghadiri konferensi. DWC adalah peneliti pascadoktoral pada proyek yang didanai oleh Pfizer dan GSK antara April 2014 dan Oktober 2017. Semua hibah dan honorarium dibayarkan ke rekening di NHS Trust atau Universitas masing-masing, atau ke badan amal independen. Semua penulis lain tidak memiliki konflik kepentingan

Informasi tambahan

Catatan Penerbit

Springer Nature tetap netral sehubungan dengan klaim yurisdiksi dalam peta yang diterbitkan dan afiliasi kelembagaan

Informasi tambahan

Berkas tambahan 1

Metode Tambahan 1

Hak dan izin

Akses Terbuka Artikel ini dilisensikan di bawah Creative Commons Attribution 4. 0 Lisensi Internasional, yang mengizinkan penggunaan, berbagi, adaptasi, distribusi, dan reproduksi dalam media atau format apa pun, selama Anda memberikan kredit yang sesuai kepada penulis(-penulis) asli dan sumbernya, menyediakan tautan ke lisensi Creative Commons, dan menunjukkan jika perubahan dilakukan. Gambar atau materi pihak ketiga lainnya dalam artikel ini termasuk dalam lisensi Creative Commons artikel, kecuali dinyatakan lain dalam batas kredit materi. Jika materi tidak termasuk dalam lisensi Creative Commons artikel dan tujuan penggunaan Anda tidak diizinkan oleh peraturan undang-undang atau melebihi penggunaan yang diizinkan, Anda harus mendapatkan izin langsung dari pemegang hak cipta. Untuk melihat salinan lisensi ini, kunjungi http. //creativecommons. org/lisensi/oleh/4. 0/

Cetak ulang dan Izin

Tentang artikel ini

Kutip artikel ini

Morris, D. E. , McNeil, H. , Hocknell, R. E. et al. Pembawa patogen saluran pernapasan bagian atas di komunitas pedesaan Sarawak, Borneo Malaysia. Pneumonia 13, 6 (2021). https. //doi. org/10. 1186/s41479-021-00084-9